COVID-19 associated pulmonary aspergillosis in critically-ill patients: a prospective multicenter study in the era of Delta and Omicron variants
Pierre Bay
,
Étienne Audureau
(1, 2, 3)
,
Sébastien Préau
(4)
,
Raphael Favory
(4)
,
Aurélie Guigon
(5)
,
Nicholas Heming
(6)
,
Elyanne Gault
(7)
,
Tài Pham
(8)
,
Amal Chaghouri
(9)
,
Matthieu Turpin
,
Laurence Morand-Joubert
(10)
,
Sébastien Jochmans
,
Aurelia Pitsch
,
Sylvie Meireles
(7)
,
Damien Contou
,
Amandine Henry
,
Adrien Joseph
(11)
,
Marie Laure Chaix
(12)
,
Fabrice Uhel
(13)
,
Damien Roux
(13)
,
Diane Descamps
(14)
,
Malo Emery
(15)
,
Claudio Garcia-Sanchez
,
David Levy
,
Sonia Burrel
(16)
,
Julien Mayaux
,
Antoine Kimmoun
(17, 18)
,
Cédric Hartard
,
Frédéric Pene
(19)
,
Flore Rozenberg
(19)
,
Stephane Gaudry
(20)
,
Segolene Brichler
(20)
,
Antoine Guillon
(21)
,
Lynda Handala
(22)
,
Fabienne Tamion
(23)
,
Alice Moisan
(23)
,
Thomas Daix
(24, 25)
,
Sébastien Hantz
(26)
,
Flora Delamaire
(27)
,
Vincent Thibault
(28, 29, 27)
,
Bertrand Souweine
(30)
,
Cécile Henquell
(30)
,
Lucile Picard
(31)
,
Françoise Botterel
,
Christophe Rodriguez
,
Armand Mekontso-Dessap
(32)
,
Jean-Michel Pawlotsky
(3)
,
Slim Fourati
,
Nicolas de Prost
(32)
1
Hôpital Henri Mondor
2 Inserm U955 - Molecular virology and immunology – Physiopathology and therapeutic of chronic viral hepatitis (Team 18)
3 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
4 Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
5 CHRU Lille - Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]
6 Hôpital Raymond Poincaré (Garches) [GHU AP-HP Université Paris-Saclay]
7 Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
8 CARMAS - Groupe de recherche clinique CARMAS (Cardiovascular and Respiratory Manifestations of Acute lung injury and Sepsis)
9 Hôpital Paul Brousse
10 iPLESP - Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique
11 AP-HP - Hopital Saint-Louis [AP-HP]
12 HIPI (UMR_S_976 / U976) - Immunologie humaine, physiopathologie & immunothérapie
13 INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) - Institut Necker Enfants-Malades
14 IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
15 Hôpital Saint-Camille [Bry-sur-Marne]
16 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
17 UL - Université de Lorraine
18 DCAC - Défaillance Cardiovasculaire Aiguë et Chronique
19 Hôpital Cochin [AP-HP]
20 Hôpital Avicenne [AP-HP]
21 CEPR - Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires (CEPR), UMR 1100
22 MAVIVHe - Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents
23 CHU Rouen
24 RESINFIT - Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques
25 CIC1435 - Centre d'Investigation Clinique de Limoges
26 CHU Limoges
27 Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Ponchaillou]
28 EHESP - École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP]
29 Irset - Institut de recherche en santé, environnement et travail
30 CHU Louise Michel [Clermont-Ferrand]
31 Service d'immunologie clinique et maladies infectieuses [Hôpitaux universitaires CHU Henri Mondor]
32 CHU Henri Mondor [Créteil]
2 Inserm U955 - Molecular virology and immunology – Physiopathology and therapeutic of chronic viral hepatitis (Team 18)
3 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
4 Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
5 CHRU Lille - Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]
6 Hôpital Raymond Poincaré (Garches) [GHU AP-HP Université Paris-Saclay]
7 Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
8 CARMAS - Groupe de recherche clinique CARMAS (Cardiovascular and Respiratory Manifestations of Acute lung injury and Sepsis)
9 Hôpital Paul Brousse
10 iPLESP - Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique
11 AP-HP - Hopital Saint-Louis [AP-HP]
12 HIPI (UMR_S_976 / U976) - Immunologie humaine, physiopathologie & immunothérapie
13 INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) - Institut Necker Enfants-Malades
14 IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
15 Hôpital Saint-Camille [Bry-sur-Marne]
16 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
17 UL - Université de Lorraine
18 DCAC - Défaillance Cardiovasculaire Aiguë et Chronique
19 Hôpital Cochin [AP-HP]
20 Hôpital Avicenne [AP-HP]
21 CEPR - Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires (CEPR), UMR 1100
22 MAVIVHe - Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents
23 CHU Rouen
24 RESINFIT - Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques
25 CIC1435 - Centre d'Investigation Clinique de Limoges
26 CHU Limoges
27 Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Ponchaillou]
28 EHESP - École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP]
29 Irset - Institut de recherche en santé, environnement et travail
30 CHU Louise Michel [Clermont-Ferrand]
31 Service d'immunologie clinique et maladies infectieuses [Hôpitaux universitaires CHU Henri Mondor]
32 CHU Henri Mondor [Créteil]
Pierre Bay
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1358091
- ORCID : 0000-0002-6751-2110
Étienne Audureau
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1163941
- ORCID : 0000-0002-6166-149X
- IdRef : 129955213
Sébastien Préau
- Fonction : Auteur
- PersonId : 778589
- ORCID : 0000-0002-8638-7183
- IdRef : 08373810X
Raphael Favory
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1256792
- ORCID : 0000-0001-7772-2608
Aurélie Guigon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 954678
Nicholas Heming
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1332346
- ORCID : 0000-0002-4537-7595
Tài Pham
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1139927
- IdHAL : tai-pham
- ORCID : 0000-0002-4373-0711
Matthieu Turpin
- Fonction : Auteur
Laurence Morand-Joubert
- Fonction : Auteur
- PersonId : 972692
Sébastien Jochmans
- Fonction : Auteur
- PersonId : 792970
- ORCID : 0000-0002-7111-4107
Aurelia Pitsch
- Fonction : Auteur
Damien Contou
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1042428
Amandine Henry
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1217600
- ORCID : 0000-0002-8935-8185
Marie Laure Chaix
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1278653
- ORCID : 0000-0002-7798-4621
Fabrice Uhel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 767111
- ORCID : 0000-0003-4946-8184
- IdRef : 157707571
Claudio Garcia-Sanchez
- Fonction : Auteur
David Levy
- Fonction : Auteur
Sonia Burrel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 777590
- ORCID : 0000-0002-7783-2601
- IdRef : 144712326
Julien Mayaux
- Fonction : Auteur
Antoine Kimmoun
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1189399
- ORCID : 0000-0002-5443-2074
Cédric Hartard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1159741
- ORCID : 0000-0001-5942-2345
- IdRef : 204237696
Frédéric Pene
- Fonction : Auteur
- PersonId : 778690
- ORCID : 0000-0003-3639-3849
- IdRef : 069669740
Stephane Gaudry
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1188358
- ORCID : 0000-0002-1105-6785
Segolene Brichler
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1369545
- ORCID : 0000-0002-7336-7730
Antoine Guillon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 773250
- ORCID : 0000-0002-4884-8620
- IdRef : 137508158
Lynda Handala
- Fonction : Auteur
- PersonId : 794019
- ORCID : 0000-0001-5033-4357
- IdRef : 228521971
Fabienne Tamion
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1327347
- ORCID : 0000-0002-3708-1460
- IdRef : 060290064
Alice Moisan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1244180
- IdHAL : alice-moisan
- ORCID : 0000-0002-1162-720X
Thomas Daix
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1079327
Flora Delamaire
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1301488
- ORCID : 0000-0002-9674-4391
Vincent Thibault
- Fonction : Auteur
- PersonId : 177779
- IdHAL : vincent-thibault
- ORCID : 0000-0001-6517-2901
- IdRef : 145706192
Cécile Henquell
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1331921
- ORCID : 0000-0003-2859-6566
Lucile Picard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1077215
Françoise Botterel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758330
- ORCID : 0000-0002-3028-2665
- IdRef : 059632526
Christophe Rodriguez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1118380
Armand Mekontso-Dessap
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1188370
- ORCID : 0000-0001-5961-5577
- IdRef : 130964603
Slim Fourati
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1184765
- ORCID : 0000-0002-1236-5467
Nicolas de Prost
- Fonction : Auteur
- PersonId : 800657
- ORCID : 0000-0002-4833-4320
- IdRef : 06976235X
Résumé
BACKGROUND: During the first COVID-19 pandemic wave, COVID-19-associated pulmonary aspergillosis (CAPA) has been reported in up to 11-28% of critically ill COVID-19 patients and associated with increased mortality. As new SARS-CoV-2 variants emerged, the characteristics of critically ill COVID-19 patients have evolved, particularly in the era of Omicron. The purpose of this study is to investigate the characteristics of CAPA in the era of new variants. METHODS: This is a prospective multicenter observational cohort study conducted in France in 36 participating intensive care units (ICU), between December 7th, 2021 and April 26th 2023. Diagnosis criteria of CAPA relied on European Confederation of Medical Mycology (ECMM)/International Society for Human and Animal Mycology (ISHAM) consensus criteria. RESULTS: 566 patients were included over the study period. The prevalence of CAPA was 5.1% [95% CI 3.4-7.3], and rose to 9.1% among patients who required invasive mechanical ventilation (IMV). Univariable analysis showed that CAPA patients were more frequently immunosuppressed and required more frequently IMV support, vasopressors and renal replacement therapy during ICU stay than non-CAPA patients. SAPS II score at ICU admission, immunosuppression, and a SARS-CoV-2 Delta variant were independently associated with CAPA in multivariable logistic regression analysis. Although CAPA was not significantly associated with day-28 mortality, patients with CAPA experienced a longer duration of mechanical ventilation and ICU stay. CONCLUSION: This study contributes valuable insights into the prevalence, characteristics, and outcomes of CAPA in the era of Delta and Omicron variants. We report a lower prevalence of CAPA (5.1%) among critically-ill COVID-19 patients than previously reported, mainly affecting intubated-patients. Duration of mechanical ventilation and ICU stay were significantly longer in CAPA patients.
Origine | Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte |
---|